Utilisation de la très haute résolution spatiale pour la caractérisation des habitats de rongeurs, vecteurs de zoonoses à la Réunion
DOI :
https://doi.org/10.52638/rfpt.2015.212Mots-clés :
Télédétection, approche orientée-objet, habitats, rats, rongeurs, PléiadesRésumé
Connaître la distribution des espèces vectrices de zoonoses est fondamentale pour comprendre les dynamiques épidémiologiques et caractériser les zones à risque. Cette distribution peut être appréhendée à différentes échelles : régionalement, l'aire de répartition de ces espèces définit les limites d'occurrence de la transmission d'agents pathogènes et, localement, leurs niches déterminent l'aléa. Cette dernière échelle requiert une connaissance très précise des milieux qui peut être acquise par l'analyse d'images satellite à très haute résolution spatiale. Dans le cadre d'un projet de recherche sur la leptospirose à La Réunion (LeptOI), cette étude propose de mesurer le potentiel d'utilisation d'une image Pléiades (pixels de 50 cm) pour caractériser la distribution locale de différents petits mammifères terrestres autour de l'Etang de Saint-Paul. Trois campagnes de piégeage ont permis la capture de 134 animaux appartenant à quatre des cinq espèces présentes à La Réunion (Rattus rattus, R. norvegicus, Suncus murinus et Tenrec ecaudatus). Une analyse orientée-objet de l'image Pléiades a permis de discriminer dix classes d'occupation des sols avec une précision totale de 83,6%. Des indices paysagers ont été calculés à partir de cette classification autour de chacun des pièges (distances les plus courtes aux classes d'occupation, densité de contours et pourcentages de surface des classes au sein de zones tampon de 50 et de 100 mètres). Trois zones (« humide », « anthropisée » et « sèche ») sont clairement discriminées par ces variables, qui pourront être utilisées comme déterminants écologiques de différents profils épidémiologiques : la zone humide étant propice à la leptospirose et la zone anthropisée étant un lieu de co-occurrence des quatre espèces et ainsi potentiellement une zone d'échanges de pathogènes.
Téléchargements
Références
Benz U.C., Hofmann P., Willhauck G., Lingenfelder I. & Heynen M. (2004). Multi-resolution, object-oriented fuzzy analysis of remote sensing data for GIS-ready information. Isprs J Photogramm, 58, 239-258.
Blaschke T. (2010). Object based image analysis for remote sensing. Isprs J Photogramm, 65, 2-16.
Bordes F., Herbreteau V., Dupuy S., Chaval Y., Tran A. & Morand S. (2013). The diversity of microparasites of rodents: a comparative analysis that helps in identifying rodent-borne rich habitats in Southeast Asia. Infection ecology & epidemiology, 3.
Dambach, P., Sié, A., Lacaux, J. P., Vignolles, C., Machault, V., & Sauerborn, R. Using high spatial resolution remote sensing for risk mapping of malaria occurrence in the Nouna district, Burkina Faso. Global Health Action, 2.
Faulquier L., Fontaine R., Vidal E., Salamolard M. & Le Corre M. (2009). Feral Cats Felis catus Threaten the Endangered Endemic Barau's Petrel Pterodroma baraui at Reunion Island (Western Indian Ocean). Waterbirds, 32, 330-336.
Girard M.-C. & Girard C.M. (2010). Traitement des données de télédétection. Deuxième édition edn.
Herbreteau V., Jittapalapong S., Rerkamnuaychoke W., Chaval Y., Cosson J.-F. & Morand S. (2011). Protocols for field and laboratory rodent studies. In. Kasetsart University Press Bangkok.
Herbreteau V., Salem G., Souris M., Hugot J.-P. & Gonzalez J.-P. (2007). Thirty years of use and improvement of remote sensing, applied to epidemiology: From early promises to lasting frustration. Health & Place, 13, 400-403.
Lacoste M., Delbosc P. & Picot F. (2011). Cahier d'habitats de La Réunion, zones humides. In: Rapport N°6, p. 290.
McFeeters S.K. (1996). The use of the normalized difference water index (NDWI) in the delineation of open water features. Int J Remote Sens, 17, 1425-1432.
McGarigal K. & Marks B.J. (1995). FRAGSTATS: Spatial Pattern Analysis Program for Quantifying Landscape Structure. In. U.S. Department of Agriculture, Forest Service, Pacific Northwest Research Station., p. 122.
Ostfeld R.S., Glass G.E. & Keesing F. (2005). Spatial epidemiology: an emerging (or re-emerging) discipline. Trends Ecol Evol, 20, 328-36.
Pagès F., Polycarpe D., Dehecq J.S., Picardeau M., Caillere N., Jaffar-Bandjee M.C., Michault A. & Filleul L. (2014). Human leptospirosis on Reunion island: past and current burden. Int J Environ Res Public Health, 11, 968-82.
Pappas G., Papadimitriou P., Siozopoulou V., Christou L. & Akritidis N. (2008). The globalization of leptospirosis: worldwide incidence trends. International Journal of Infectious Diseases, 12, 351-7.
Tollenaere C., Brouat C., Duplantier J.M., Rahalison L., Rahelinirina S., Pascal M., Mone H., Mouahid G., Leirs H. & Cosson J.F. (2010). Phylogeography of the introduced species Rattus rattus in the western Indian Ocean, with special emphasis on the colonization history of Madagascar. Journal of Biogeography, 37, 398-410.
Téléchargements
Publié-e
Comment citer
Numéro
Rubrique
Licence
Les auteurs conservent les droits d'auteur et accordent à la revue le droit de première publication de l'œuvre sous une licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 qui permet à d'autres de partager l'œuvre avec une reconnaissance de la paternité de l'œuvre et de sa publication initiale dans cette revue.